Obrada digitalnih medicinskih slika
Kratica: ODMSRG Opterećenje: 15(P) + 0(S) + 0(KL) + 0(KI) + 15(PK) + 0(SK) + 0(L) + 0(M) + 0(PKL) + 0(T) + 0(K)
Nositelji: Prof. dr. sc. Tomislav Bokulić
Izvođači: Prof. dr. sc. Tomislav Bokulić ( Vježbe u praktikumu )
Opis predmeta: Izborni kolegij "Obrada digitalne medicinske slike" pohađa se tijekom . 3. semestra, u trajanju od 15 sati predavanja i 15 sati vježbi. Predavanja se održavaju u predavaonici opremljenoj projektorom povezanim s računalom a vježbe u informatičkoj učionici prema utvrđenom rasporedu. Tijekom kolegija studenti stječu znanja potrebna za razumijevanje obrade i elemente analize digitalnih slika u medicini.
U uvodu se iznosi temeljna definicija digitalne slike, opisuju postupci obrade digitalne slike i primjeri koji su povezani s različitim modalitetima oslikavanja, ciljevi obrade digitalne slike te matematički način prikazivanja slika.
Objašnjavaju se pojmovi Nyquistove frekvencije, prerušavanja frekvencija, veze uzorkovanja i konvolucije, proširenje razmatranja s jedne na dvije odnosno tri dimenzije. Iznosi se pojam funkcije odziva na točkaste izvore i njezine uloge u digitalnom oslikavanju. Obrađuju se modeli boja, kvantizacija te formati slika.
Od sljedećih većih cjelina obrađuju se postupci obrade slike u kojima se direktno rukuje s nivoima sivila u digitalnoj slici: primjeri jednostavnog preslikavanja nivoa sivila, istezanje kontrasta, histogrami slika, operacije s većim brojem slika, zbrajanje, oduzimanje i slične jednostavne operacije.
Kategorije prostornih operacija fokusiraju se na niskopropusne i visokopropusne filtere, te osnovne postupke rotacije, translacije i uspostave razmjera (engl. scalinga) slika. Obrađuju se zatim važni elementi poput morfoloških operacija, načini poboljšanja slika i obnavljanja kojima se otklanja uzrok koji je narušio kvalitetu slike i segmentiranje slika.
Na kraju se osim komprimiranja digitalnih slika obrađuje i fuzija odnosno usklađivanje slika različitih modaliteta što zauzima posebno važno mjesto u oslikavanju u posljednjih nekoliko godina. Na kraju, iznose se primjeri slikovnih metoda i obrada slika važnih za planiranje radioterapije.
Pojedinačnim radom s programskom podrškom koja je javno dostupna (public domain software, npr. ImageJ) te komercijalnim programima IDL i Matlab studentima se omogućava bolje razumijevanje kako matematičkih algoritama tako i njihove izvedbe na računalima.
Jezici na kojima se održava nastava: - - -
Obavezna literatura: - - -
Preporučena literatura: - - -
Legenda
P - Predavanja
T - Terenske vježbe
K - Konstrukcijske vježbe
S - Seminar
KL - Kliničke vježbe
KI - Vježbe primijenjene kineziologije
PK - Vježbe u praktikumu
SK - Sekcijske vježbe
L - Laboratorijske vježbe
M - Metodičke vježbe
PKL - Posebne kliničke vježbe
* - Predmet se ne polaže